形成智力落后的原因十分复杂，现在已经知道的就有二百多种，而这些原因只能说明一小部分较为严重的智力落后者的成因，绝大部分智力落后者的病因还不是非常清楚。
先天因素
先天因素指遗传因素或胎儿在母亲子宫内所碰到的一些“事情”或情况，它们对胎儿的发育有不同程度的不良影响。科学叫告诉我们，约有50%的受精卵在真正成为“胚胎”以前就死去了，极大部分死于染色体异常或其他畸形。有些受到过一些不良影响的胎儿即使侥幸存货下来，其体质、智力也会不正常，因此必须防止先天因素对个体发育的不良影响，即实行优生。
造成智力落后的先天因素主要可分以下几种：
（一） 遗传性疾病
遗传性疾病主要可以分为染色体异常和代谢性缺陷两大类。近二十多年来，由于医学遗传学的迅猛发展，被发现的遗传性疾愈来愈多，总数已接近3000种，其中大多会造成智力落后。另外，近亲结婚也可引起子代的遗传性疾病。
1． 染色体异常
由于某种偶然因素，或由于不良遗传，染色体会发生一些变化，因而形成遗传性疾病。
2． 代谢性异常
由于代谢异常，身体不能理由某些物质，这些人的大脑都有不同程度的损伤，因此几乎所有患者都成为智力落后者。
3． 近亲结婚
同样异常基因的叠加使到患病的可能增大。
（二）母孕期问题